菲律宾的清关流程一般是接受申报、审核单证、审核单证、办理征税，最后结关放行。清关即结关，是指进出口或转运货物出入一国关境时，依照各项法律法规和规定应当履行的手续。货物在结关期间，不论是进口、出口或转运，都是处在海关监管之下的，不准自由流通。

　　 菲律宾清关需要准备用于计证关税的商业发票、注明运输费用和重量的提单和货物清单。发运货物必须要有注明单件货物清单。

　　 清关只有在履行各项义务，办理海关申报、查验、征税、放行等手续后，货物才能放行，货主或申报人才能提货。

　　 载运进出口货物的各种运输工具进出境或转运，也都需要向海关申报、办理海关手续，得到海关的许可方可出入境或转运。